Ну раз вы утвержаете, что и топливный насос в норме (по давлению) и инжекторы Вы проверяли и чистили, и MAF сенсор в порядке, остается проверить только систему VVTi. На сколько я знаю, с 2005 (ретайлинг) года на ДВС 2UZ- FE, стали устанавливать муфты VVTi на впуск (на красивой пластиковой крышке ДВС это указано), если муфты или клапана ими управляющие будут подклинивать (момент изменения фазы перекрытия клапанов) то и разряжение в коллекторе будет меняться, на что и реагирует MAF сенсор (давая неправельные показания), ну и как ранее говорил, в определенных режимах работы ДВС из за неправельного момента перекрытия клапанов, смесь будет бедной.