Если нет проблем на стоке,они могут выявиться на тюнинговой прошивке.Почему?Надеюсь понимаете что прошивка настроена более тонко чем стоковая т.е.углы смеси и.т.д. Некоторые отклонения параметров двигателя от нормы могут вызвать такое ухудшение ездовых качеств.На полностью исправном авто такого как правило не происходит.Я бы для начала как следует посмотрел ВВ провода и КЗ осциллографом,и ещё кое какие параметры. Неспроста решили перешить чтобы уменьшить расход и явно авто никто не диагностировал до репрога.Подерготины такой как здесь написали,на этих прошивках не замечал.Наоборот наблюдается мягкая работа двигателя на ХХ которое сразу отмечают клиенты и интенсивное ускорение без рывков при тапке в пол.Возможно вам делали репрог-прошивальчики а не диагносты.
И впредь советовал бы попридержать свой гонор на человека уважаемого на этом форуме.Он правильно написал не нравиться катайся на стоке тем более проблем с авто как написали никаких не было.